魔法,这一曾经只存在于幻想中的力量,如今已成为现实中的技术,并确立了其地位约有一个世纪之久。在国立魔法大学附属第一高校,也就是人们熟知的“第一高校”,迎来了一对特别的兄妹。哥哥达也,作为魔法师却有着致命的缺陷,被视为劣等生;而妹妹深雪,则是一位各方面都完美无缺的优等生。两人的校园生活充满了接连不断的动荡与挑战。
他们先是遭遇了政治结社“布兰修”的袭击,随后在九校战中又面临了香港系国际犯罪集团“无头龙”的介入。紧接着,大亚联合军对横滨发起了侵攻,一种能够侵蚀人类精神并使其变质的魔物“寄生”也悄然出现。更令人意想不到的是,USNA军魔法师部队“STARS”总队长安吉·天狼星,即安洁莉娜·九重·谢尔兹,也突然来访。
经过这一系列波折重重的一年,达也和深雪终于升入了二年级,他们的生活也开始逐渐发生变化。四叶家派来的樱井水波开始与达也他们同居,而达也也决定转学到新设立的魔法工学科,简称“魔工科”。原本,达也希望能和深雪一起过上平静的校园生活,但世界似乎并不打算轻易放过他们。
转眼间,达也和深雪在第一高校迎来了第二个春天。达也内心渴望今年能和深雪一起度过一个平静的校园生活,然而,今年的一年级新生中同样不乏问题学生。七草真由美的双胞胎妹妹香澄和泉美,以及与七草家有着强烈对抗意识的七宝琢磨,这三人入学不久就惹出了不少麻烦,让达也不得不忙于应对。
而在这一切的背后,一个神秘的青年周公瑾正暗中策划着阴谋。他煽动人类至上主义者,企图将魔法师从社会中排除出去。青春与阴谋交织的“Double Seven篇”就此拉开帷幕,达也和深雪的校园生活又将迎来怎样的挑战与波折呢?